伊吾县医疗保障局设有办公室、综合业务科（医药价格和招标采购科）、基金监管科、财务科4个内设机构：

（一）办公室。负责机关文电、安全、保密、会务、机要、档案、信息化建设等机关日常运转及后勤保障工作，承担综合协调、信访、政务公开等工作，承担政策宣传、新闻发布等工作，负责党群、机构编制、干部人事、队伍建设等工作。

科室负责人：阿娜也提·阿不来孜

联系电话：0902-6590151

（二）综合业务科（医药价格和招标采购科）。负责医疗保险政策的实施和待遇支付；负责县医疗救助工作；负责定点医疗机构、定点零售药店费用结算工作；负责数据统计和分析。贯彻落实药品、医用耗材价格和医疗服务项目、医疗服务设施收费等政策并组织实施，拟订贯彻公立医疗机构医疗服务价格管理办法并组织实施；贯彻落实药品、医用耗材的招标采购、配送及结算管理政策；建立医药价格信息监测和信息发布制度。

科室负责人：帕哈尔丁·玉素甫江

联系电话：0902-6722088

1. 基金监管科。拟订医疗保障基金监督管理办法并组织实施。建立健全医疗保障基金安全防控机制，医疗保障信用评价体系和信息披露制度。监督管理纳入医保支付范围的医疗服务行为和医疗费用，规范医保经办业务，依法查处医疗保障领域违法违规行为。

   科室负责人：王兵

   联系电话：0902-6590151

   （四）财务科。编制医疗保障基金预决算草案；负责医疗保障基金财务日常核算工作；负责财务统计报表工作；负责定期对医疗保障基金的运营情况进行分析、研究和预测；负责单位财务资产管理和内部审计工作。

   科室负责人：李琴

   联系电话：0902-6590151